Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms