Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rrn3B2RS91 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rrn3B2RS91 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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