Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ythdc2B2RR83 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ythdc2B2RR83 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ythdc2B2RR83 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ythdc2B2RR83 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ythdc2B2RR83 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ythdc2B2RR83 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ythdc2B2RR83 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ythdc2B2RR83 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ythdc2B2RR83 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ythdc2B2RR83 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ythdc2B2RR83 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms