Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H60cB1B213 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H60cB1B213 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H60cB1B213 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms