Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm2012B1B0R1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2012B1B0R1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms