Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn8B1ARD8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slfn8B1ARD8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms