Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gbp4A4UUI3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms