Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b5A3FIN4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms