Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scn3aA2ASI5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Scn3aA2ASI5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms