Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Rtf1A2AQ19 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Rtf1A2AQ19 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Rtf1A2AQ19 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Rtf1A2AQ19 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Rtf1A2AQ19 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rtf1A2AQ19 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms