Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb1A2AQ07 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms