Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1aA2APX8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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