Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtcflA2APF3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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