Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GabreA2AMW3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms