Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lcn6A2AJB9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn6A2AJB9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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