Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Prdm12A2AJ77 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prdm12A2AJ77 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms