Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Frmpd4A2AFR3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms