Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms