Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprfA2A8L5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprfA2A8L5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PtprfA2A8L5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PtprfA2A8L5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PtprfA2A8L5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprfA2A8L5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprfA2A8L5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprfA2A8L5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprfA2A8L5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprfA2A8L5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprfA2A8L5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprfA2A8L5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprfA2A8L5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprfA2A8L5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprfA2A8L5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprfA2A8L5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprfA2A8L5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtprfA2A8L5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms