Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp1bA1Z198 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nlrp1bA1Z198 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms