Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav12-2A0N8N6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav12-2A0N8N6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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