Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm3550W4VSN7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms