Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CcniQ9Z2V9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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