Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms