Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Vamp5Q9Z2P8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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Vamp5Q9Z2P8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Vamp5Q9Z2P8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Vamp5Q9Z2P8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Vamp5Q9Z2P8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Vamp5Q9Z2P8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Vamp5Q9Z2P8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Vamp5Q9Z2P8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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