Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms