Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps6ka4Q9Z2B9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms