Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cldn8Q9Z260 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn8Q9Z260 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
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