Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cpne6Q9Z140 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne6Q9Z140 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms