Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema4fQ9Z123 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema4fQ9Z123 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms