Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ccl8Q9Z121 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl8Q9Z121 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl8Q9Z121 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl8Q9Z121 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl8Q9Z121 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl8Q9Z121 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl8Q9Z121 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ccl8Q9Z121 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl8Q9Z121 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl8Q9Z121 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl8Q9Z121 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl8Q9Z121 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ccl8Q9Z121 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ccl8Q9Z121 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ccl8Q9Z121 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ccl8Q9Z121 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ccl8Q9Z121 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ccl8Q9Z121 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl8Q9Z121 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl8Q9Z121 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ccl8Q9Z121 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ccl8Q9Z121 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl8Q9Z121 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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