Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf13bQ9WU72 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms