Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vax2Q9WTP9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms