Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TapbpQ9R233 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms