Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hic1Q9R1Y5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hic1Q9R1Y5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms