Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt71Q9R0H5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms