Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BcamQ9R069 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcamQ9R069 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcamQ9R069 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcamQ9R069 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcamQ9R069 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcamQ9R069 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcamQ9R069 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcamQ9R069 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcamQ9R069 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BcamQ9R069 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BcamQ9R069 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcamQ9R069 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcamQ9R069 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcamQ9R069 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcamQ9R069 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcamQ9R069 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcamQ9R069 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BcamQ9R069 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms