Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp11cQ9QZW0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp11cQ9QZW0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms