Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rnf4Q9QZS2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf4Q9QZS2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf4Q9QZS2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf4Q9QZS2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf4Q9QZS2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf4Q9QZS2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rnf4Q9QZS2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf4Q9QZS2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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