Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Col4a4Q9QZR9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Col4a4Q9QZR9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Col4a4Q9QZR9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Col4a4Q9QZR9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Col4a4Q9QZR9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col4a4Q9QZR9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Col4a4Q9QZR9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Col4a4Q9QZR9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col4a4Q9QZR9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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