Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Npas3Q9QZQ0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms