Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms