Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg1Q9QZE5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms