Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpc3Q9QZC1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc3Q9QZC1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms