Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Six6Q9QZ28 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Six6Q9QZ28 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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