Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChmQ9QXG2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms