Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim44Q9QXA7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim44Q9QXA7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms