Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Dkk3Q9QUN9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms