Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm29018-201ENSMUST00000188707 925 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msh5Q9QUM7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms