Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms